Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms