Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk1P22518 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms