Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb9P20615 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms