Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou5f1P20263 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms