Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RargP18911 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RargP18911 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RargP18911 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RargP18911 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RargP18911 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RargP18911 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RargP18911 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RargP18911 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms