Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps6ka3P18654 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms