Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms