Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nme1P15532 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme1P15532 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme1P15532 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme1P15532 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme1P15532 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme1P15532 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme1P15532 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme1P15532 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms