Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrphP15331 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrphP15331 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrphP15331 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrphP15331 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrphP15331 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrphP15331 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrphP15331 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrphP15331 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrphP15331 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrphP15331 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrphP15331 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrphP15331 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrphP15331 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrphP15331 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrphP15331 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrphP15331 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrphP15331 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrphP15331 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrphP15331 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrphP15331 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrphP15331 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms