Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp54P14576 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms