Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg5P12961 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg5P12961 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scg5P12961 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms