Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chrm1P12657 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chrm1P12657 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms