Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga5P11688 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga5P11688 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga5P11688 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga5P11688 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga5P11688 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga5P11688 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga5P11688 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga5P11688 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga5P11688 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga5P11688 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga5P11688 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms