Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms