Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sbk3P0C5K0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms