Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sod1P08228 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms