Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spta1P08032 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spta1P08032 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spta1P08032 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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