Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamc1P02468 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc1P02468 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms