Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01680 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01680 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01680 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01680 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01680 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01680 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01680 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01680 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01680 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01680 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01680 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms