Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01667 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01667 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01667 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01667 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01667 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01667 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01667 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms