Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01652 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01652 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01652 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01652 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01652 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01652 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01652 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01652 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01652 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01652 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01652 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01652 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01652 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01652 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01652 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01652 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms