Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnpda1O88958 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnpda1O88958 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms