Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3bO88509 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms