Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp4O70480 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms