Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb5O70309 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb5O70309 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms