Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad51dO55230 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms