Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChkbO55229 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ChkbO55229 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms