Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OtogO55225 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtogO55225 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OtogO55225 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtogO55225 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtogO55225 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OtogO55225 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms