Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp2a2O55143 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms