Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BckdkO55028 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms