Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnk2O54967 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnk2O54967 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms