Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FxnO35943 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FxnO35943 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FxnO35943 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FxnO35943 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FxnO35943 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FxnO35943 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FxnO35943 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FxnO35943 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FxnO35943 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FxnO35943 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FxnO35943 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FxnO35943 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FxnO35943 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FxnO35943 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FxnO35943 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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