Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gp1baO35930 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1baO35930 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms