Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NudcO35685 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NudcO35685 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NudcO35685 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NudcO35685 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NudcO35685 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NudcO35685 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NudcO35685 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NudcO35685 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NudcO35685 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NudcO35685 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms