Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edil3O35474 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edil3O35474 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edil3O35474 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Edil3O35474 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Edil3O35474 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms