Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1dO35473 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1dO35473 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1dO35473 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms