Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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Abcc1O35379 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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Abcc1O35379 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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Abcc1O35379 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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Abcc1O35379 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcc1O35379 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abcc1O35379 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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