Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna3O35344 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna3O35344 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms