Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pitx3O35160 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms