Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr1aO35134 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Polr1aO35134 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr1aO35134 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms