Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
IfnabL7MTU6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms