Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC024978J3QPC3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC024978J3QPC3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms