Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm29394H3BIW7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms