Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pabpc4lG5E8X2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms