Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcf11G3X9Z4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcf11G3X9Z4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms