Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Arid4aF8VPQ2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Arid4aF8VPQ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms