Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17555F6U8B9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms