Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc141E9Q8Q6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc141E9Q8Q6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc141E9Q8Q6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc141E9Q8Q6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc141E9Q8Q6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc141E9Q8Q6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc141E9Q8Q6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc141E9Q8Q6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc141E9Q8Q6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms