Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnmb3E9Q7U0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms