Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef5E9Q7D5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef5E9Q7D5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms